东南大学“计算机科学与技术”学科拥有该博士点，包括了“计算机应用技术”、“计算机软件和理论”、 “计算机系统结构”与“图象处理与科学可视化”全部4个博士点和硕士点，其中“计算机应用技术”学科1994年被评为江苏省重点学科，在1996年、1998年和2000年历次评估中均被评为A级，1999年设立教育部长江特聘教授岗，2002年被评选为国家重点学科，2007年圆满通过国务院学位办组织的评估，成为新一轮的国家重点学科。2001年被批准建立“计算机科学与技术”一级学科博士后流动站。

　　本一级学科主要有七个研究方向：计算机网络及其应用、数据库及信息系统、人工智能及其应用、软件工程及理论、理论计算机科学、计算机系统结构、图象处理与科学可视化。

　　（1）计算机网络及其应用：高性能网络体系结构及其协议、分布对象计算及CORBA技术、协议工程、网络安全、网络管理、网格计算、网络行为学、面向海量数据处理应用的相关算法和大型系统构造技术、大规模存储体系结构、网络教育、网络制造、电子商务。

　　（2）数据库和信息系统：数据库管理系统、异构数据集成、数据仓库与数据挖掘、移动数据库系统及其应用、Web数据管理、企业信息系统、XML数据管理技术、数据流管理、生物信息学、工作流技术。

　　（3）人工智能及其应用：分布式人工智能与多Agent系统、人工神经网络、模糊信息处理与决策、模糊模式识别、不精确信息处理、地理信息模型与空间推理等方面。

　　（4）软件工程及理论：程序设计语言、软件分析与测试、软件质量保证、软件形式化技术、新型软件方法与技术、知识与信息获取技术、语义Web与Web工程、面向对象技术。

　　（5）理论计算机科学：量子计算、信息理论、模糊理论、近似算法、随机算法、分布式算法。

　　（6）计算机系统结构：嵌入式应用系统与嵌入式操作系统、现代工业控制系统体系结构、集群系统体系结构和并行计算、保安监控系统。

　　（7）图象处理与科学可视化：数字图像处理、成像技术、三维显示和虚拟现实技术、计算机辅助精确放疗、图像引导手术、辅助诊断和图像网络。